Francisco J.M. Mojica es va llicenciar en Biologia (Universitat de València; 1986) i després de completar la seua tesi doctoral sobre la resposta d'arqueges halófilas a estrès ambiental (Universitat d'Alacant i Université Paris-Sud, França; 1993), va realitzar una primera estada postdoctoral en la Universitat d'Utah (EUA, 1993), on va investigar sobre fisiologia bacteriana, seguida d'una segona estada en la Universitat d'Oxford (Regne Unit, 1995-1996) per a investigar sobre regulació gènica i topologia de l'ADN. En 1997, va tornar a la Universitat d'Alacant com a Professor Titular de Microbiologia, fundant el grup de recerca Microbiologia Molecular, centrat en l'estudi dels sistemes CRISPR.