Plant Proteomics and Functional Genomics

General data

Field of study:

Experimental Sciences

Director:

BRU MARTINEZ, ROQUE

Website:

http://imem.ua.es/es/quienes-somos/roque-bru-marti

E-mail:

roque.bru@ua.es

Telephone:

+34 965903400 x 3113

Annual reports

Annual report

Polyphenol oxidases and lipoxygenases
aislamiento y caracterización enzimática de estas enzimas en tejidos vegetales
Plant proteomics and functional genomics
abordaje de problemas de diversa índole en plantas -fisiopatías nutricionales, manipulación del metabolismo secundario, control de enzimas relacionadas con la calidad de frutos comestibles-, mediante el análisis del proteoma y de Genómica funcional con el fin de determinar a nivel molecular las proteínas implicadas en estos procesos
Enzyme systems involved in the quality of edible fruit
determinación y evolución de enzimas implicados en el color -polifenoloxidasas-, flavor -lipoxigenasas- y textura -poligalacturonasas- en frutos de consumo
Production of bioactive natural compounds by plant cell culture
inducción de cultivos para producir metabolitos secundarios; análisis cualitativo y cuantitativo de metabolitos secundarios; produccion en biorreactor
Allergenic proteins from plants and foods
Metabolic engineering of natural bioactive plant compounds

Services offered
Results
Available relevant infrastructure

Services offered

1. Analisis del proteoma de tejidos vegetales y cualquier otro origen biológico (tejidos animales, cultivos microbiologicos, fluidos biológicos) 2. Identificación/caracterización de proteínas mediante técnicas de espectrometría de masas: MALDI-TOF (peptide mass fingerprints) y UHPL/nanoLC-MS/MS (busqueda MS/MS en bases d datos, secuenciación de novo, modificaciones postraduccionales) 3. Proteómica cuantitativa: DIGE, marcaje isotópico (iTRAQ, TMT), label free, MRM 4. Extracción, purificacion y caracterizacion de proteínas vegetales 5. Estudio, seguimiento y control de problemas de pardeamiento enzimático y magulladura en frutas y verduras 6. Estudio, seguimiento y control de proteínas de frutas y verduras implicadas en seguridad alimentaria (alergias, intolerancias) 7. Analisis funcional de genes y proteinas vegetales 8. Iniciación, establecimiento y mantenimiento de suspensiones celulares 9. Cultivo de suspensiones celulares en biorreactor de laboratorio (2 litros) y planta piloto (7 litros)

Results

1. Análisis de proteínas y proteomas vegetales: vid, tomate, melocoton, ciruela, tabaco,trigo etc.., tanto de tejidos verdes como partes comestibles estas plantas, y cultivos celulares. 2. Producción de compuestos naturales bioactivos mediante cultivo de células vegetales. El resveratrol ha sido reconocido como una sustancia natural con efectos beneficiosos para la salud debido a sus propiedades antioxidantes y anticancerígenas. Tecnología en la Universidad de Alicante: producción de resveratrol in-vitro a partir de cultivos celulares de vid. Estos cultivos, al igual que la uva, son capaces de producir picos de resveratrol en respuesta a elicitores. Mediante tecnología propia de estimulacion de las suspensiones celulares, los cultivos sintetizan una elevada cantidad de tran-resveratrol, que se acumula en el medio extracelular a concentraciones superiores a 4g/l, con un nivel de producción superior a 250 mg/g peso seco de células. Esta tecnología está implementada en biorreactores de escala piloto hasta 7L. 3. Ingeniería del metabolismo secundario en cultivos celulares de vid. El siguiente paso en el desarrollo tecnologico de la produccion de compuestos naturales bioactivos mediente cultivos celulares vegetales es la manipulación genética del cultivo para incrementar y diversificar los compuestos de interés. En este sentido se ha conseguido obtener productos derivados del resveratrol con mejores propiedades farmacológicas, en particular Pterostilbeno y Piceatanol. Visitar la web para una relacion actualizada de publicaciones. MAS INFORMACION: http://www.ua.es/otri/servicios/oferta_cientifica/ot_ual/TO-RESVERATROL.doc http://www.ua.es/otri/servicios/oferta_cientifica/ot_ual/TEC_UA_resveratrol.doc

Available relevant infrastructure

-Electroforesis 2D proteínas (IPGphor, Ettan Dalt6) -Sistema análisis geles (Image scanner Power LookIII Umax, Fluorimager Typhoon 4210 (SSTI), Software analisis SameSpots,Dispositivo tinción automática, Spot picker) -Espectrometros de masas para análisis de proteínas MALDI-TOF reflectron y 2D-nanoLC-ESI-trampa iónica, UHPLC/ChipCube-QTOF, UHPLC/ChipCube-QQQ (SSTTI) -Cromatografía líquida baja-media presión preparativa (Akta Purifier) -Espectrofotómetro (Jasco V-530) -Incubador termostatizado con agitación orbital y luz, operacion ciclica (Multitron Infors) -Fermentador laboratorio totalmente automatizado (Biostat B-BBraun Biotech) -Centrífuga concentradora -Ultracongelador -86ºC -Cabina flujo laminar -Autoclave -Rotores de alta capacidad -Ultrafiltración tangencial -Incubador termostatizado con agitacion orbital y fotoperiodo

Proyectos See search box

Project type:

Public

Competitive

European

From

RELEVANT CONTRIBUTIONS TO RESEARCH PROJECTS

Project title: APROXIMACIONES MULTI-OMICAS EN CULTIVOS CELULARES VEGETALES ELICITADOS: DE LA EXPLORACIÓN DEL METABOLISMO ESPECIALIZADO AL DESARROLLO DE FACTORIAS CELULARES VERDESING
Reference: CIAICO/2021/167

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: GENERALITAT VALENCIANA
Starting date: 01/01/2022
Termination date: 31/12/2024
Project title: Cultivo de células vegetales en biorreactores: Biofactorías para la obtención de compuestos naturales bioactivos de interés industrial.ING
Reference: IMPULSO2013-PE01

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: UNIVERSIDAD DE ALICANTE
Starting date: 19/12/2013
Termination date: 18/06/2015
Project title: Ayudas María Zambrano par la atracción de talento internacional. Estancia realizada en: Departamento de Agroquímica y Bioquímica de la Universidad de AlicanteING
Reference: ZAMBRANO21-20

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: MINISTERIO DE UNIVERSIDADES
Starting date: 01/03/2022
Termination date: 31/12/2024
Project title: Estrategias para incrementar y diversificar la producción de estilbenos y flavolignanos en cultivos celulares vegetalesING
Reference: BIO2011-29856-C02-02

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: MINISTERIO DE ECONOMIA Y EMPRESA
Starting date: 01/01/2012
Termination date: 31/12/2014
Project title: DESARROLLO E IMPLEMENTACIÓN DE PROCESOS DE RECUPERACIÓN DE COMPUESTOS DE VALOR AÑADIDO DE MOSTOS CONCENTRADOS [ACRONIMO: CIRCUMOSTO.21]ING
Reference: JSOLER1-21I

Competitive: No

European: No

Public: No

Project sponsors: JULIAN SOLER, S.A.
Starting date: 29/04/2021
Termination date: 28/07/2022
Project title: Acquisition of emerging tools and techniques for metabolome analysis and application to plants with pharmacological and nutraceutical propertiesING
Reference: CIBEST/2023/15

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: Conselleria de Educación, Universidades y Empleo
Starting date: 01/06/2024
Termination date: 31/10/2024
Project title: LIF: Proteínas alergénicas de plantas y alimentosING
Reference: LIF_roque.bru2

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: UNIVERSIDAD DE ALICANTE
Starting date: 02/02/2024
Termination date: 31/12/2040
Project title: Proteómica y genómica funcional de plantas - VIGROB-105 ING
Reference: UADIF23-18

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: UNIVERSIDAD DE ALICANTE
Starting date: 01/01/2024
Termination date: 31/12/2024
Project title: Proteómica y genómica funcional de plantas - VIGROB-105 ING
Reference: VIGROB23-105

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: UNIVERSIDAD DE ALICANTE
Starting date: 01/01/2024
Termination date: 31/12/2024
Project title: Transducción de señales en bacterias - VIGROB-126 ING
Reference: UADIF22-27

Competitive: Yes

European: No

Public: Yes

Project sponsors: UNIVERSIDAD DE ALICANTE
Starting date: 01/01/2023
Termination date: 31/12/2023

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Books

Book chapters

Articles

Conferences

From year

To year

RELEVANT CONTRIBUTIONS IN JOURNALS

Title: A focused multiple reaction monitoring (MRM) quantitative method for bioactive grapevine stilbenes by ultra high performance liquid chromatography coupled to triple-quadrupole mass spectrometry (UHPLC-QqQ)
Authors: , Hurtado-Gaitán, E.; Sellés, S.; , Sellés-Marchart, S.; Martínez-Márquez, A.; Samper-Herrero, A.; Bru-Martinez, R.
Journals Molecules
Volume: 22
Pages: 1 - 15
Date: 2017
ISSN: 1420-3049
Title: Resveratrol and cyclodextrins, an easy alliance: Applications in nanomedicine, green chemistry and biotechnology
Authors: , Jeandet, P.; , Sobarzo-Sanchez, E.M; , Uddin, S.; Bru-Martinez, R.; , Bru, R.; , Clement, C.; , Jacquard, C.; , Nabavi, S.F.; , Khayatkashani, M.; , Batiha, G.E.; , Khan, H.; , Morkunas, I.; , Trotta, F.; , Matencio, A.; , Nabavi, S.M.
Journals Biotechnology Advances
Volume: 53
Pages: -
Date: 2021
ISSN: 0734-9750
DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2021.107844
Title: Down-Regulation of Phosphoenolpyruvate Carboxylase Kinase in Grapevine Cell Cultures and Leaves Is Linked to Enhanced Resveratrol Biosynthesis
Authors: , Hurtado-Gaitán, E.; Sellés, S.; , Hartwell, J.; Martínez-Esteso, M.J.; Bru-Martinez, R.
Journals Biomolecules
Volume: 11:1641
Pages: -
Date: 2021
ISSN: 2218-273X
Title: Production of highly bioactive resveratrol analogues pterostilbene and piceatannol in metabolically engineered grapevine cell cultures
Authors: Martínez-Márquez, A.; Morante-Carriel, J.; , Ramírez-Estrada, K.; , Palazon, J.; , Cusidó, R.M.; Bru-Martinez, R.
Journals Plant Biotechnology Journal
Volume: 14
Pages: 1813 - 1825
Date: 2016
ISSN: 1467-7644
Title: A Tau Class Glutathione-S-Transferase is Involved in Trans-Resveratrol Transport Out of Grapevine Cells
Authors: Martínez-Márquez, A.; Martínez-Esteso, M.J.; Vilella-Antón, M.T.; Sellés, S.; , Sellés-Marchart, S.; Morante-Carriel, J.; , Morante-Carriel, J.A.; , Hurtado, E.; , Palazon, J.; Bru-Martinez, R.
Journals Frontiers in Plant Science
Volume: 8
Pages: 1417/1 - 1417/15
Date: 2017
ISSN: 1664-462X
DOI: http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2017.01457
Title: Effect of addition of yeasts and enzymes during fermentation on physicochemical quality of fine aroma cocoa beans
Authors: Morales Rodríguez, Wiston; Morante-Carriel, J.; Herrera Feijoo, Robinson J.; Ayuso Yuste, María Concepción; Bernalte García, María Josefa
Journals Journal of Agriculture and Food Research
Volume:
Pages: -
Date: 2024
ISSN: 2666-1543
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jafr.2024.101126
Title: Factors affecting the bioproduction of resveratrol by grapevine cell cultures under elicitation
Authors: Vera-Urbina, J.C.; Sellés, S.; Martínez-Márquez, A.; Martinez-Esteso, M. J. ; , M. Angeles Pedreño-García; Morante-Carriel, J. A. ; Bru-Martinez, R.
Journals Biomolecules
Volume: 13:1529
Pages: -
Date: 2023
ISSN: 2218-273X
DOI: http://dx.doi.org/10.3390/biom13101529
Title: Factors Affecting the Bioproduction of Resveratrol by Grapevine Cell Cultures under Elicitation
Authors: Morante-Carriel, J.
Journals Biomolecules
Volume: 13
Pages: 1 - 20
Date: 2023
ISSN: 2218-273X
DOI: doi.org/10.3390/biom13101529
Title: High variability of perezone content in rhizomes of Acourtia cordata wild plants, environmental factors related, and proteomic analysis
Authors: García-Méndez, Maria del Carmen; Encarnación-Guevara, Sergio; Martinez-Batallar, Angel Gabriel; Gómez-Caudillo, Leopoldo; Bru-Martinez, R.; Martínez-Márquez, A.; Sellés, S.; Tovar-Sanchez, Efrain; Alvarez-Berber, Laura; Marquina-Baena, Silvia; Perea-Arango, Irene; Arellano-García, José de Jesús
Journals PeerJ
Volume: 11:e16136
Pages: 1 - 27
Date: 2023
ISSN: 2167-8359
DOI: http://dx.doi.org/10.7717/peerj.16136
Title: Insights into enhancing Centella asiatica organ cell biofactories via hairy root protein profiling
Authors: Alcalde, Miguel Angel; Hidalgo-Martinez, Diego; Bru-Martinez, R.; Sellés, S.; Bonfill, Mercedes; Palazón, Javier
Journals Frontiers in Plant Science
Volume: 14:1274767
Pages: -
Date: 2023
ISSN: 1664-462X
DOI: doi: 10.3389/fpls.2023.1274767

RELEVANT PUBLISHED BOOKS

No data.

RELEVANT PUBLISHED BOOK CHAPTERS

Book chapter title: Influencia del déficit hídrico sobre la expresion de proteínas en el hollejo en uva cv. Tempranillo
Authors: , Uriarte, D.; , Almagro, L.; , Mancha, L.A.; , Borja, M.; , Moreno, D.; Bru-Martinez, R.; , Novo-Uzal, E.; , Alarcón, M.V.; , Pedreño, M.A.
Editorial: Sociedad Española de Ciencias Hortícolas
Pages: 218 - 222
Date: 2016
ISBN:
Book title: Actas de Horticultura 76. II Jornadas del Grupo de Viticultura
Book chapter title: Bioproduction of trans-resveratrol from grapevine cell cultures
Authors: , Almagro, L.; , Belchí-Navarro, S.; , Sabater-Jara, A.B.; Vera-Urbina, J.C.; Sellés, S.; , Sellés-Marchart, S.; Bru-Martinez, R.; , Pedreño-García, M.A.
Editorial: Springer-Verlag
Pages: 1683 - 1713
Date: 2013
ISBN:
Book title: Natural Products
Book chapter title: Differential plant proteome analysis by isobaric tags for relative and absolute quantitation
Authors: Martínez-Esteso, M.J.; Casado-Vela, J.; Sellés, S.; , Sellés-Marchart, S.; , Pedreño, M.A.; Bru-Martinez, R.
Editorial: Humana Press
Pages: 155 - 169
Date: 2013
ISBN:
Book title: Plant proteomics: methods and protocols
Book chapter title: Production of Grapevine Cell Biomass (Vitis vinifera L. Gamay) and Resveratrol in Custom and Commercial Bioreactors using Cyclodextrins and with Methyl-Jasmonate Elicitors
Authors: Vera-Urbina, J.C.; Sellés, S.; , Sellés-Marchart, S.; Martínez-Esteso, M.J.; , Pedreño, M.A.; Bru-Martinez, R.
Editorial: NOVA Science Publishers, Inc
Pages: 19 - 39
Date: 2013
ISBN:
Book title: Resveratrol: Sources, Production and Health Benefits
Book chapter title: Suspension cultured-plant cells as a tool to analyze the extracellular proteome
Authors: , Sabater-Jara, A.B.; , Almagro, L.; , Belchí-Navarro, S.; Martínez-Esteso, M.J.; , Youssef, S.M.; Casado-Vela, J.; Vera-Urbina, J.C.; Sellés, S.; , Sellés-Marchart, S.; Bru-Martinez, R.; , Pedreño, M.A.
Editorial: Humana Press
Pages: 407 - 433
Date: 2013
ISBN:
Book title: Plant proteomics: methods and protocols
Book chapter title: Dimethyl Labeling-Based Quantitative Proteomics of Recalcitrant Cocoa Pod Tissue
Authors: Esteve Sánchez, Yoel; Morante-Carriel, J.; Martínez Márquez, Ascensión; , Susana Sellés-Marchart; , Roque Bru-Martínez
Editorial:
Pages: -
Date: 2020
ISBN:
Book title: Methods Mol Biol.

DOI: doi.org/10.1007/978-1-0716-0528-8
Book chapter title: Effect of UV light on secondary metabolite biosynthesis in plant cell cultures elicited with cyclodextrins and methyl jasmonate
Authors: , Almagro, L.; , Sabater-Jara, A.B.; , Belchí-Navarro, S.; , Fernández-Pérez, F.; Bru-Martinez, R.; , Bru, R.; , Pedreño, M.A.
Editorial: Intech
Pages: -
Date: 2011
ISBN:
Book title: Abiotic Stress/Book 3
Book chapter title: Elaboración de las guías docentes y coordinación del primer curso de Grado en Óptica y Optometría
Authors: Caballero, MT; Angulo, A.; Bru-Martinez, R.; , Bru, R.; Cuenca, N.; Gandía Tortosa,C.; , Gandía, C.; González, C.; Hernandez, C.; Ivorra, I.; Pastor, Isidro M.; , Pastor, I.; Perez, J.; Trottini,M
Editorial: ICE/Vicerrectorado de Estudios e Innovación Educativa, Universidad de Alicante
Pages: 1612 - 1626
Date: 2010
ISBN:
Book title: La comunidad universitaria: tarea investigadora ante la práctica docente

RUA: http://hdl.handle.net/10045/19884
Book chapter title: Guías docentes para las asignaturas de Bioquímica de primer curso en los Grados de Biología y Óptica.
Authors: Camacho, M.; Bonete, M.J.; Bru-Martinez, R.; Ferrer, J.; Llorca, F.I.; Bautista-Saiz, V. ; , VILELLA ANTÓN, Mª T.
Editorial:
Pages: 91 - 110
Date: 2010
ISBN:
Book title: La comunidad universitaria: tarea investigadora ante la práctica docente.

RUA: http://hdl.handle.net/10045/19884
Book chapter title: Trabajo interdisciplinar para la coordinación del primer curso de Grado en Óptica y Optometría
Authors: Caballero, MT; , Caballero Caballero, Mª.T.; Angulo, A.; , Angulo Jerez, A; Bru-Martinez, R.; , Bru Marínez,R.; Cuenca, N.; , Cuenca-Navarro, N.; Gandía Tortosa,C.; González, C.; , González Pérez,C. Hernández Poveda,C.; Hernandez, C.; , Ivorra Pastor, I; Ivorra, I.; , Pastor Beviá,I.; Pastor, Isidro M.; , Pérez Rodríguez,J.; Trottini,M; Perez, J.
Editorial: UNIVERSIDAD DE ALICANTE
Pages: 1106 - 1118
Date: 2010
ISBN:
Book title: Nuevas Titulaciones y Cambio Universitario

RUA: http://hdl.handle.net/10045/19881

RELEVANT CONFERENCE PAPERS

Title: Proteomics-driven discovery of an ABC transporter B family menber (VvABC-B) in elicited grapevine cells:functional analysis as a trans-resveratrol transporter
Authors: Martínez-Márquez, A.; , Sellés-Marchart, S.; , Martins, V.; Sellés, S.; , Gerós, H.; Bru-Martinez, R.
Type of participation: Ponencia
Conference name: Fourth (4th)
Event type: Europeo
City of performance: Winnipeg (CANADÁ)
Date of performance: 09/03/2021
Title: Proteomics-driven discovery of a tau class glutathione-S-transferase (GSTU-2) involved in trans-resveratrol transport in grapevine cells
Authors: Martínez-Márquez, A.; , Vilella-Antón, M.T.; Martínez-Esteso, M.J.; , Sellés-Marchart, S.; , Palazon, J.; Sellés, S.; , Morante-Carriel, J.A.; Morante-Carriel, J.; , Hurtado, E.; Bru-Martinez, R.
Type of participation: Ponencia
Conference name: Third (3rd)
Event type: Europeo
City of performance: Padova (ITALIA)
Date of performance: 09/09/2018
Title: MRM-mediated quantitation of phosphorylation in a grapevine phsphoenolpyruvate carboxylase
Authors: , Sellés-Marchart, S.; Sellés, S.; , Hurtado-Gaitán, E.; Bru-Martinez, R.
Type of participation: Ponencia
Conference name: Third (3rd)
Event type: Europeo
City of performance: Padova (ITALIA)
Date of performance: 09/09/2018
Title: Metabolic engineering and elicitation strategies to produce stilbenoids in plant cell cultures
Authors: Bru-Martinez, R.; , Palazon, J.; Martínez-Márquez, A.; , Morante-Carriel, J.A.; Morante-Carriel, J.; , Hurtado-Gaitán, E.; , Corchete, P.; Sellés, S.
Type of participation: Ponencia invitada
Conference name: 3rd International Conference on Plant Biology
Event type: Internacional
City of performance: Belgrado (SERBIA)
Date of performance: 09/06/2018
Title: An omics exploration of elicitor-mediated stilbenoids accumulation in grapevine (Vitis vinifera L.) cell cultures
Authors: , Vilella-Antón, M.T.; , Sellés-Marchart, S.; , Almagro, L.; , Morante-Carriel, J.A.; , Pedreño-García, M.A.; , Martinez-Esteso, M.J.; , Hurtado-Gaitán, E.; Bru-Martinez, R.
Type of participation: Ponencia invitada
Conference name: 1st INPPO World Congress on Plant Proteomics: Methodology to Biology
Event type: Europeo
City of performance: Hamburgo (ALEMANIA)
Date of performance: 31/08/2014
Title: Looking for allergenic proteins in almond pollen
Authors: Samper-Herrero, A.
Type of participation: Póster
Conference name: VII Meeting for Young Proteomics Researchers organized by SEProt (Sociedad Española de Proteómica)
Event type: Nacional
City of performance: Madrid (MADRID) (ESPAÑA)
Date of performance: 15/02/2023
Title: Importancia de la proteómica en la detección e identificación de nuevos alérgenos presentes en el polen
Authors: Samper-Herrero, A.
Type of participation: Ponencia
Conference name: IV Congreso Internacional de Desarrollo Universitario-CIDU 2022
Event type: Internacional
City of performance: Quevedo (ECUADOR)
Date of performance: 07/12/2022
Title: Estudio de la aplicación de tecnologías docentes universitarias no presenciales en titulaciones científico-técnicas
Authors: Font, A.; Aracil, I.; Blasco, I.; Camacho, M.; Fernández-Torres, M.J.; Salcedo-Díaz, R.; Gómez-Siurana, A; Samper-Herrero, A.
Type of participation: Póster
Conference name: VI Congreso de Innovación Docente en Ingeniería Química (CIDIQ)
Event type: Europeo
City of performance: Madrid (MADRID) (ESPAÑA)
Date of performance: 11/07/2022
Title: Análisis de tecnologías docentes aplicadas a la docencia universitaria no presencial en titulaciones cientifico-técnicas.
Authors: Font, A.; Aracil, I.; Blasco, I.; Camacho, M.; Fernández-Torres, M.J.; Gómez-Siurana, A; Salcedo-Díaz, R.; Samper-Herrero, A.; , A. Gómez; , Ledesma, I.
Type of participation: Comunicación
Conference name: XIX Jornadas de Redes de Investigación en Docencia Universitaria- REDES 2021 IV Workshop Internacional de Innovación en Enseñanza Superior y TIC- INNOVAESTIC 2021
Event type: Local
City of performance: (ESPAÑA)
Date of performance: 10/06/2021
Title: Application of MRM for grapevine organelle abundance profiling analysis in cell-suspension culture
Authors: Martínez-Márquez, A.; , Sellés-Marchart, S.; , Martins, V.; Sellés, S.; , Gerós, H.; Bru-Martinez, R.
Type of participation: Ponencia
Conference name: Fourth (4th)
Event type: Europeo
City of performance: Winnipeg (CANADÁ)
Date of performance: 09/03/2021