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Course description
 

26524 - MICROBIOLOGIA (2011-12)

General  

Code: 26524
Lecturer responsible:
SANTOS SANCHEZ, FERNANDO
Credits ECTS: 6,00
Theoretical credits: 1,52
Practical credits: 0,88
Distance-base hours: 3,60

Departments involved

Study programmes where this course is taught



Competencies and objectives

Course context for academic year 2011-12

La Microbiología es la ciencia que estudia los microorganismos y constituye una de las materias fundamentales de la Biología. En esta asignatura se pretende dar una visión básica de las características esenciales de los microorganismos, con especial énfasis en los microorganismos procariotas (Bacteria y Archaea). La asignatura se cursa en el tercer cuatrimestre del grado de Biología, tras haberse cursado durante los dos primeros cuatrimestres las materias consideradas de formación básica.

Los microorganismos son los seres vivos más abundantes del planeta Tierra y constituyen una parte considerable de la biomasa. A través de su papel central en los ciclos biogeoquímicos (algunos de cuyos procesos son exclusivamente procarióticos), contribuyen de manera esencial al funcionamiento global del planeta y ayudan al desarrollo sostenible de la biosfera. Juegan, además, una función muy relevante en las actividades humanas, tanto como agentes patógenos como por sus funciones protectoras o su utilización en procesos de gran interés económico y medioambiental. Son también importantes herramientas para el estudio de la evolución y de la diversificación de los seres vivos.

El conocimiento de la Microbiología es pues central para la comprensión de la Vida y por tanto es parte esencial de la formación básica de los futuros biólogos. Por otra parte, la Microbiología es especialmente necesaria en el ejercicio profesional de la Biología dentro del ámbito sanitario (en el laboratorio clínico o en el control de la seguridad alimentaria, por ejemplo), en determinadas actividades industriales y en muy distintos ámbitos de la investigación (desde la Microbiología Molecular a la Ecología Microbiana).

 

 

Course content (verified by ANECA in official undergraduate and Master’s degrees)

Competències específiques:>>de coneixement

  • CE1 : Posseir coneixements bàsics de l'estructura molecular, genètica, organització cel·lular, processos evolutius dels éssers vius.
  • CE10 : Conèixer les diferents adaptacions (morfològiques, fisiològiques, conducta) dels éssers vius en l'ambient marí.
  • CE16 : Conèixer i interpretar els factors que influeixen en el clima i en l'hidrodinamisme marí.
  • CE18 : Conèixer els aspectes lligats al canvi climàtic global i els seus registres.
  • CE6 : Conèixer i comprendre els fets essencials, conceptes, principis i teories relacionades amb les ciències marines, i la seua relació amb altres ciències.
  • CE7 : Conèixer l'organització estructural i funcional dels organismes marins, i també comprendre la seua diversitat biològica.

 

Competències específiques:>> d'habilitat

  • CE20 : Demostrar el coneixement i la comprensió dels mètodes inductius i deductius, elaboració d'hipòtesis i disseny experimental.
  • CE21 : Utilitzar la informació i documentació necessària en la separació, identificació i catalogació d'organismes marins.
  • CE27 : Tenir destresa en l'ús pràctic de models, i incorporar-hi noves dades per a la seua validació, millora i evolució.
  • CE30 : Ser capaç de dur a terme procediments estàndards de mostreig en el mar i en el laboratori implicats en treballs de recerca.
  • CE31 : Elaborar, presentar i defensar textos i informes científics, tant de manera escrita com oral davant d'una audiència.

 

Exclusive skill taught in this course

No data

Training objectives

GRAU EN BIOLOGIA

  • Estudiar l'origen de la vida, l'evolució dels éssers vius, des dels primers microorganismes fins a la diversificació dels eucariotes, i el paper dels microorganismes en l'establiment i manteniment de la biosfera i la interacció amb els humans.
  • Estudiar i identificar la diversitat filogenètica i genòmica, a més de l'estructura i funció dels microorganismes i interpretar la diversitat d'espècies de filotipus en el medi, l'origen, l'evolució, el comportament i els cicles biològics.
  • Conèixer els principis de la sistemàtica i la filogènia microbianes i saber identificar, analitzar i catalogar microorganismes.
  • Identificar els principals metabolismes procariòtics (quimiolitotròfia, respiracions anaeròbies, fotosíntesi oxigènica i anoxigènica, fermentació, etc.).
  • Aïllar, conrear i modificar virus i microorganismes procariotes i eucariotes.
  • Dissenyar, planificar, executar i exposar treballs i projectes científics en el camp de la microbiologia.
  • Manipular amb seguretat material biològic i saber manejar i aplicar la tècnica estèril.


GRAU EN CIÈNCIES DEL MAR

  • Tenir coneixements bàsics de l'estructura molecular, la genètica, l'organització cel·lular, els processos evolutius dels éssers vius i l'organització dels ecosistemes.
  • Conèixer i comprendre els fets essencials, els conceptes, els principis i les teories relacionades amb les ciències marines.
  • Conèixer les diverses adaptacions (morfològiques, fisiològiques, conductuals) dels microorganismes en l'ambient marí. Entendre els conceptes de filotip i ecotip.
  • Conèixer el paper dels microorganismes en els cicles dels gasos amb efecte hivernacle i albedo.
  • Conèixer les modernes tècniques d'estudi de la funció, la diversitat i l'abundància dels microorganismes marins.
  • Conèixer i aplicar els coneixements adquirits en els estudis d'impacte ambiental i la qualitat ambiental marina.
  • Dur a terme procediments estàndards de mostreig, a la mar o el laboratori, implicats en treballs de recerca, a més de fer, presentar i defensar informes científics per escrit i oralment davant una audiència.

Specific objectives stated by the academic staff for academic year 2011-12

  • Identificar a los microorganismos como los seres vivos más abundantes y más diversos de la Tierra
  • Conocer la diversidad y ubicuidad de los microorganismos

Content and bibliography

Content for academic year 2011-12

PROGRAMA TEORÍA

1. La Microbiología. Concepto de Microbiología. Historia de la Microbiología. Abundancia e importancia de los microorganismos. Clasificación. Los tres dominios. Taxonomía y filogenia. Cronómetros moleculares. Evolución y diversidad de los microorganismos. (3 horas)
2. Estructura y función de la célula procariótica. Morfología. Citoplasma y orgánulos procarióticos. Membrana citoplasmática de procariotas. Paredes celulares de procariotas. Estructuras externas a la pared celular. Exoflagelos y endoflagelos. Deslizamiento. La endospora bacteriana. (5 horas)
3. Genética bacteriana. El genoma procariota. Cromosomas y plásmidos. Genómica y metagenómica. Mecanismos de transferencia horizontal: transformación, conjugación y transducción. Recombinación y transposición. (4 horas)
4. Crecimiento microbiano. División celular en procariotas. Cultivo continuo y cultivo discontinuo. Factores que influyen en el crecimiento. Control del crecimiento microbiano. Medios de cultivo. La técnica estéril. Extremofilia. Estrategias de supervivencia en procariotas. (3 horas)
5. Metabolismo microbiano. Fuentes de carbono y energía. Categorías metabólicas. Respiración. Fermentación. Fotosíntesis en procariotas. Quimiolitotrofía. Autotrofía. Fijación de nitrógeno (3 horas)
6. Dominio Bacteria. (12 horas)
       6.1. Diversidad y filogenia del dominio Bacteria. Importancia aplicada.
       6.2. Phylum Cyanobacteria.
       6.3. Phylum Proteobacteria.
              6.3.1.Alfa-Proteobacterias: Rhizobium, Agrobacterium, “bacterias del ácido acético”, Caulobacter.
              6.3.2.Beta-Proteobacterias: Neisseria, Thiobacillus, Zoogloea.
              6.3.3.Delta-Proteobacterias: “bacterias sulfatorreductoras”, Bdellovibrio, “mixobacterias.
              6.3.4.Epsilon-Proteobacterias: Campylobacter, Helicobacter. 
            6.3.5.Gamma-Proteobacterias: “enterobacterias”, Legionella, Haemophilus, Vibrio, “bacterias oxidadoras del azufre”.
              6.3.6. "Bacterias rojas", "metanotrofos", "bacterias nitrificantes", "rickettsias"
       6.4. Phylum Spirochaeta. Treponema, Borrelia
       6.5. Phylum Bacteroidetes. Bacteroides, Cytophaga
       6.6. Phylum Actinobacteria. Mycobacterium, Corynebacterium, Streptomyces
       6.7. Phylum Chlamydiae. Chlamydia
       6.8. Phylum Firmicutes. “Bacterias del ácido láctico”, Bacillus, Clostridium, Staphylococcus, Listeria
       6.9. Phylum Tenericutes. Micoplasmas
       6.10. Otros phyla: Chlorobi, Chloroflexi, Deinococcus-Thermus, Planctomycetes.
7. Dominio Archaea. (3 horas)
       7.1. Diversidad y filogenia del dominio Archaea. Importancia aplicada.
       7.2. Phylum Euryarchaeota: halófilos extremos, metanógenos, termófilos, hipertermófilos, euriarqueas marinas.
       7.3. Phylum Crenarchaeota: termófilos, hipertermófilos, acidófilos.
       7.4. Phylum Thaumarchaeota: mesófilos oxidadores de amonio.
       7.4. Otros phyla: Nanoarchaeota, Korarchaeota
8. Microorganismos del Dominio Eukarya. Hongos microscópicos y protozoos. Importancia aplicada. (2 horas)
9. Virus. La “viriosfera”. Propiedades generales de los virus. Cultivo y análisis de virus. Virus de Bacteria. Virus de Archaea. Virus de eucariotas. Estrategias de replicación y síntesis de componentes en virus. Ciclo lítico y ciclo lisogénico. Importancia aplicada de los virus. (3 horas)

PROGRAMA DE PRÁCTICAS
1.- Preparación de medios de cultivo. Preparación, esterilización y dispensación de los medios de cultivo que se utilizarán en las prácticas.
2.- Técnicas de aislamiento, siembra e incubación de microorganismos.  Siembra por agotamiento y triple estría. Efectos de la temperatura y ausencia de oxígeno en la incubación.
3.- Ubicuidad de los microorganismos: Toma de muestras de garganta, piel, superficie, aire, suspensión de suelo y cultivo ambiente.
4.- Esterilidad y contaminación. Evaluación de la ebullición y la radiación ultravioleta como métodos esterilizantes o desinfectantes.
5.- Crecimiento bacteriano. Curva de crecimiento bacteriana y recuentos de células.
6.- Efecto de aireación y antibióticos sobre el crecimiento. Comparación del crecimiento de cultivos con diferentes condiciones de aireación y adición de distintos antibióticos.
7.- Identificación bacteriana. Caracterización de un organismo problema a través del análisis de su metabolismo, fisiología y estructura (observación con el microscopio en fresco y de tinción Gram).
8.- Antibiograma y agentes antimicrobianos. Análisis de resistencia bacteriana a distintos compuestos según la formación de halos de inhibición del crecimiento.
9.- Infección por bacteriófagos. Formación de calvas de lisis.

 

Related links

No data

 

Bibliography

No data

Assessment

Assessment procedures and criteria 2011-12

La asistencia será obligatoria únicamente en las prácticas de laboratorio (habrá que asistir, como mínimo, al 80%) y tutorías grupales, siendo voluntaria en las clases de teoría. Las pruebas teórico-prácticas referentes a las prácticas de laboratorio, así como las tutorías grupales, las exposiciones orales y las observaciones del profesor formarán parte de la evaluación continua, que supondrá un 50% de la nota de la asignatura. A este respecto, cada alumno deberá obtener, como mínimo, un 4 en la nota correspondiente a "observaciones del profesor" para aprobar la asignatura.

El examen escrito, o prueba final, sobre los aspectos teóricos y tutorías grupales constituirá el otro 50% de la nota.

Las notas correspondientes a la evaluación continua se mantendrán durante dos cursos académicos.

Las pruebas escritas constarán de preguntas de test y de cuestiones.

Tras la primera convocatoria de la asignatura, la nota final estará constituida por la nota obtenida en la prueba final y la nota obtenida en la evaluación continua, siempre que se haya obtenido al menos un 4 en la nota correspondiente a "observaciones del profesor". En la segunda convocatoria de la asignatura, se realizará únicamente una prueba escrita sobre los contenidos teóricos y tutorías grupales, que constituirá un 50% de la nota, a la que habrá que sumar la nota obtenida en la evaluación continua.

NOTA: el cronograma confeccionado en esta guía docente refleja el trabajo de un alumno perteneciente a un grupo de prácticas determinado. Dadas las características de las prácticas de laboratorio de la asignatura (intensivas), las horas correspondientes al trabajo de laboratorio para los alumnos del resto de grupos deberán adaptarse según el horario establecido.

Description Criteria Type Weighting system
OBSERVACIONES DEL PROFESOR

Evaluación de la adquisición de habilidades prácticas y de la asistencia y aprovechamiento de las sesiones de laboratorio. Ha de obtenerse, al menos, un 4 para poder superar la asignatura

ACTIVITATS D'AVALUACIÓ DURANT EL SEMESTRE 10
EXPOSICIONES ORALES

Exposición individual de los resultados de las prácticas. Se realizará en la última sesión práctica de laboratorio

ACTIVITATS D'AVALUACIÓ DURANT EL SEMESTRE 10
REALIZACIÓN DE TRABAJOS DIRIGIDOS O CASOS PRÁCTICOS

Resolución, tanto en grupo como individual, de casos prácticos, planteamiento y resolución de cuestiones y análisis de noticias de prensa relacionadas con la Microbiología.

ACTIVITATS D'AVALUACIÓ DURANT EL SEMESTRE 10
PRUEBAS TEÓRICO-PRÁCTICAS ESCRITAS

Prueba escrita individual donde se evaluará el aprendizaje de los contenidos de las clases prácticas. Se realizará en la última sesión práctica de laboratorio

ACTIVITATS D'AVALUACIÓ DURANT EL SEMESTRE 20
PRUEBA FINAL

Examen escrito individual donde se evaluará el aprendizaje de los contenidos de las clases teóricas y tutorías grupales

EXAMEN FINAL 50

 

Official exam dates for academic year 2011-12

Exam session Date Time Group - Classroom(s) allocated Comments
(C2) Període ordinari per a assignatures de primer semestrre 26/01/2012 15:00 - 18:00 CI/0002 
CI/0003 
(JUL) Període extraordinari de juliol 13/07/2012 14:30 - 17:30 CI/0001 
CI/0002 

 

 



Academic staff

SANTOS SANCHEZ, FERNANDO
Lecturer responsible

  • CLASSE TEÒRICA: Groups:
    • 1
    • 2
    • 3
  • PRÀCTIQUES DE LABORATORI: Groups:
    • PLA1
    • PLA7
  • TUTORIES GRUPALS: Groups:
    • PTG1
    • PTG2
    • PTG3
    • PTG4
    • 5
    • 7
    • 8

ALMENDROS ROMERO, CRISTOBAL

  • PRÀCTIQUES DE LABORATORI: Groups:
    • PLA1
    • PLA4
    • CML1
    • CML2
    • PLA7

ANTON BOTELLA, JOSEFA

  • CLASSE TEÒRICA: Groups:
    • 1
    • 2

DIEZ VILLASEÑOR, CESAR

  • PRÀCTIQUES DE LABORATORI: Groups:
    • PLA2
    • PLA3

MARTINEZ GARCIA, MANUEL

  • PRÀCTIQUES DE LABORATORI: Groups:
    • PLA8

 

Groups

CLASSE TEÒRICA

Group Semester Morning or afternoon session Language No. of enrolled students On registration, assigned to On registration, distribution
Gr. 1 (CLASSE TEÒRICA ) : 1.1 1S Tot el dia CAS 75
  • Permet GRAU EN BIOLOGIA
From ID document number A - To ID document number Z
Gr. 2 (CLASSE TEÒRICA ) : 2 1S Matí CAS 37
  • Permet GRAU EN CIÈNCIES DEL MAR
From ID document number A - To ID document number Z
Gr. 3 (CLASSE TEÒRICA ) : 1.2 1S Tot el dia CAS 75
  • Permet GRAU EN BIOLOGIA
From ID document number A - To ID document number Z


PRÀCTIQUES DE LABORATORI

Group Semester Morning or afternoon session Language No. of enrolled students
Gr. CML1 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 5 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. CML2 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 6 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. PLA1 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 1 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. PLA2 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 2 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. PLA3 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 3 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. PLA4 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 4 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. PLA7 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 7 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0
Gr. PLA8 (PRÀCTIQUES DE LABORATORI ) : GRUPO 8 PRÁCTICAS LABORATORIO AN Tot el dia CAS 0


TUTORIES GRUPALS

Group Semester Morning or afternoon session Language No. of enrolled students
Gr. PTG1 (TUTORIES GRUPALS ) : GRUPO 1 TUTORÍAS 1S Vesprada CAS 0
Gr. PTG2 (TUTORIES GRUPALS ) : GRUPO 2 TUTORÍAS 1S Vesprada CAS 0
Gr. PTG3 (TUTORIES GRUPALS ) : GRUPO 3 TUTORÍAS 1S Vesprada CAS 0
Gr. PTG4 (TUTORIES GRUPALS ) : GRUPO 4 TUTORÍAS 1S Vesprada CAS 0
Gr. 5 (TUTORIES GRUPALS ) : GRUPO 5 TUTORÍAS 1S Vesprada CAS 0
Gr. 7 (TUTORIES GRUPALS ) : 7 1S Vesprada CAS 0
Gr. 8 (TUTORIES GRUPALS ) : 8 1S Vesprada CAS 0




Timetables

CLASSE TEÒRICA

Group Start date End date Day Start time End time Lecture room
1 13/09/2011 16/09/2011 MAR 15:00 16:00 CI/0001  
1 13/09/2011 16/09/2011 JUE 16:00 17:00 CI/0001  
1 19/09/2011 02/12/2011 LUN 15:00 16:00 CI/0001  
1 19/09/2011 02/12/2011 MAR 15:00 16:00 CI/0001  
1 19/09/2011 02/12/2011 JUE 16:00 17:00 CI/0001  
1 12/12/2011 23/12/2011 MAR 15:00 16:00 CI/0001  
1 12/12/2011 23/12/2011 JUE 16:00 17:00 CI/0001  
2 13/09/2011 20/10/2011 LUN 16:00 17:00 TQ/1002  
2 13/09/2011 20/10/2011 MAR 16:00 17:00 TQ/1002  
2 13/09/2011 20/10/2011 JUE 17:00 18:00 TQ/1002  
2 24/10/2011 24/10/2011 LUN 16:00 17:00 TQ/1002  
2 25/10/2011 01/12/2011 LUN 16:00 17:00 TQ/1002  
2 25/10/2011 01/12/2011 MAR 16:00 17:00 TQ/1002  
2 25/10/2011 01/12/2011 JUE 17:00 18:00 TQ/1002  
2 13/12/2011 22/12/2011 MAR 16:00 17:00 TQ/1002  
2 13/12/2011 22/12/2011 JUE 17:00 18:00 TQ/1002  
3 13/09/2011 02/12/2011 LUN 15:00 16:00 CI/0003  
3 13/09/2011 02/12/2011 MAR 15:00 16:00 CI/0003  
3 13/09/2011 02/12/2011 JUE 16:00 17:00 CI/0003  
3 12/12/2011 23/12/2011 MAR 15:00 16:00 CI/0003  
3 12/12/2011 23/12/2011 JUE 16:00 17:00 CI/0003  

PRÀCTIQUES DE LABORATORI

Group Start date End date Day Start time End time Lecture room
CML1 31/10/2011 07/11/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
CML1 31/10/2011 07/11/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
CML1 31/10/2011 07/11/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
CML1 31/10/2011 07/11/2011 VIE 11:00 14:00 0012PB010  
CML1 08/11/2011 08/11/2011 MAR 10:00 14:00 A2/0D13  
CML2 09/11/2011 16/11/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
CML2 09/11/2011 16/11/2011 MAR 11:00 14:00 0012PB010  
CML2 09/11/2011 16/11/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
CML2 09/11/2011 16/11/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
CML2 17/11/2011 17/11/2011 JUE 10:00 14:00 A1/0-11P  
PLA1 19/09/2011 23/09/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA1 19/09/2011 23/09/2011 MAR 11:00 14:00 0012PB010  
PLA1 19/09/2011 23/09/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA1 19/09/2011 23/09/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA1 19/09/2011 23/09/2011 VIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA1 26/09/2011 26/09/2011 LUN 10:00 11:00 0012PB010  
PLA1 26/09/2011 26/09/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA2 27/09/2011 03/10/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA2 27/09/2011 03/10/2011 MAR 11:00 14:00 0012PB010  
PLA2 27/09/2011 03/10/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA2 27/09/2011 03/10/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA2 27/09/2011 03/10/2011 VIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA2 04/10/2011 04/10/2011 MAR 10:00 14:00 A2/0D13  
PLA3 05/10/2011 13/10/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA3 05/10/2011 13/10/2011 MAR 11:00 14:00 0012PB010  
PLA3 05/10/2011 13/10/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA3 05/10/2011 13/10/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA3 14/10/2011 14/10/2011 VIE 10:00 14:00 A1/1-29M  
PLA4 17/10/2011 21/10/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA4 17/10/2011 21/10/2011 MAR 11:00 14:00 0012PB010  
PLA4 17/10/2011 21/10/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA4 17/10/2011 21/10/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA4 17/10/2011 21/10/2011 VIE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA4 24/10/2011 24/10/2011 LUN 10:00 14:00 A2/0A02  
PLA7 17/11/2011 17/11/2011 JUE 11:00 14:00 0004PB017  
PLA7 21/11/2011 23/11/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA7 21/11/2011 23/11/2011 MAR 11:00 11:30 0012PB010  
PLA7 21/11/2011 23/11/2011 MAR 11:30 14:00 0012PB010  
PLA7 21/11/2011 23/11/2011 MIE 11:30 14:00 0012PB010  
PLA7 21/11/2011 23/11/2011 MIE 11:00 11:30 0012PB010  
PLA7 24/11/2011 24/11/2011 JUE 11:00 14:00 0012PB010  
PLA7 25/11/2011 25/11/2011 VIE 10:00 14:00 A1/0-10P  
PLA8 28/11/2011 30/11/2011 LUN 11:00 14:00 0012PB010  
PLA8 28/11/2011 30/11/2011 MIE 11:00 14:00 0012PB010  
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